Музей истории Южно-Уральского государственного медицинского университета был открыт в августе 1984 г. (в 1984 г. – «Музей истории Челябинского медицинского института») в связи с празднованием 40-летнего юбилея ВУЗа.

Музей создан силами преподавателей кафедры Социальной гигиены и организации здравоохранения ЧГМИ (ныне – кафедра Общественного здоровья и здравоохранения ЮУГМУ):  «… с целью создания музея истории Челябинского медицинского института приказываю: поручить организацию музея института коллективу кафедры социальной гигиены и организации здравоохранения (приказ по Челябинскому медицинскому институту № 64 от 29 апреля 1983 г.).

Руководители Музея истории ЧГМИ/ЧелГМА/ЮУГМУ (в разные годы): Галина Васильевна Иванова (старший преподаватель кафедры Истории КПСС и политэкономии ЧГМИ – с 1984 г.),  Минна Петровна Филимонова (преподаватель кафедры Истории КПСС и политэкономии ЧГМИ), Борис Григорьевич Девятьяров (к.м.н., доцент кафедры Микробиологии, вирусологии, иммунологии и клинической лабораторной диагностики ЧелГМА – с 2007 г.), выпускница кафедры Туризма и музееведения ЧГАКИ Майя Николаевна Ломова (с апреля 2014 г).

Со дня своего основания Музей нацелен на сотрудничество с преподавателями, студентами и школьниками. Основные формы работы – проведение лекций, экскурсий, оказание методической помощи, участие в воспитательной и профориентационной работе. Музей ЮУГМУ является участником районных, городских смотров, конкурсов и конференций.

- Мемориальные коллекции профессорско-преподавательского состава ВУЗа (к. XIX - к. XX вв.);
- История южноуральского здравоохранения (XX в.) ;
- Студенческие научные работы (2-я пол. XX в.);
- Подшивка ВУЗовской газеты За народное здоровье" (с 1957 г.);
- Медицинские, физические приборы и инструменты (кон. XIX - XX вв.);
- Анатомические плакаты (1940-е гг. - 1990-е гг.);
- Альбомы выпусков врачей (1946 - 1990 гг.);
- Учебная, научная, художественная литература (кон. XIX - XXI вв.);
- Материалы, относящиеся  к общественной студенческой жизни (2-я пол. XX в.);
- Документы студентов медицинских учебных заведений и врачей (1-я пол. XX в.).

«Альбом эвакуационного госпиталя № 1722», возглавляемого знаменитым хирургом доцентом Петром Михайловичем Тарасовым, в котором представлен фотоотчёт о проводимой работе медперсонала госпиталя по лечению и реабилитации раненых бойцов (1943 г.);

«Дневник рейсовых итогов за 1944 год», в котором отмечались проводимые мероприятия для раненых военнослужащих, вывозимых с места боя в тыл для лечения летом указанного года;

«Руководство по судебной медицине» (1891 г.) интересное тем, что оно является переведённым с немецкого языка и адаптированным к судебному законодательству Российской Империи конца XIX в.;

"Вольтметр" 1940 г., привезённых сотрудниками Киевского медицинского института осенью 1941 г. в наш город в эвакуацию; "Альбом II выпуска ЧМИ" (1946 г.).

"Год рождения - сорок четвертый" (история становления и развития ВУЗа).

"История развития здравоохранения на Южном Урале".

"Свято и ревностно память народа Ваши хранит имена" (о ветеранах ВОВ  - преподавателях и сотрудниках ВУЗа).