«Музей истории МОНИКИ» создан в 2003 г. и является подразделением Научно-Медицинской Библиотеки ГБУЗ МО МОНИКИ им. М.Ф. Владимирского.

Библиотека была организована в 20-х годах XIX века на базе небольшого книжного собрания по инициативе видных деятелей российской медицины трудившихся в Старо-Екатерининской больнице. Уже на протяжении более 200 лет библиотека аккумулирует в своих фондах книги и периодические издания, отражающие все передовые достижения медицины, материалы конференций проводимых институтом, монографии и труды врачей трудившихся в его стенах, диссертации, защищенные в диссертационном совете МОНИКИ.

Фонды библиотеки содержат свыше 340 тысяч единиц хранения, в том числе поистине уникальный фонд редких книг конца XIX – начала XX вв. Так же с 70-х годов XX века по инициативе заведующей библиотеки (с 1961 г. по 2013 г.) Фенелоновой Марты Васильевны и благодаря энтузиазму врача, выпускника Московского Областного Клинического Института – Мед. ВУЗа (так до 1943 года назывался МОНИКИ) Величко Вячеслава Сильвестровича, был собран богатый исторический предметно-документальный фонд, на основе которого, по инициативе и под руководством заместителя директора МОНИКИ по научной работе с 1987 г. по 2014 г. профессора Вячеслава Ивановича Шумского, был открыт музей истории МОНИКИ. В творческую группу создателей так же входили: челен-корр. РАМН, проф. Г. А. Оноприенко (директор МОНИКИ с 1987 г. по 2013 г.), д.м.н., проф. П.В. Астахов, С. М. Бронников и А.А. Марусин.

В настоящее время научно-историческая работа музея ведется заведующим научно-медицинской библиотеки ГБУЗ МО МОНИКИ к.м.н. Лобановым Александром Юрьевичем.